Concorrendo ao segundo mandato, Marcos Caldas foi tido como supresa nas eleições de 2006. Elegeu-se pelo minúsculo PTdoB.
Na Assembléia, chegou com a desconfiança de parte da mídia, mas conseguiu se firmar com discursos polêmicos e projetos de repercussão estadual – como a lei que proíbe o fumo em qualquer ambiente público.
Nas eleições de 2008 teve forte atuação em São Luís, ao lado do irmão, Augusto Caldas, candidato a vereador. No segundo turno, apoiou a candidatura de Flávio Dino (PCdoB) a prefeito.
Em setembro do ano passado, denunciando perseguição política do PTdoB, trocou de partido e seguiu para o PRB. O TRE deu ganho de causa ao parlamentar, avalizando sua transferência partidária.
O site de Marcos Caldas na internet tem o endereço www.marcoscaldas.com.br